Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NgfrQ9Z0W1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NgfrQ9Z0W1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NgfrQ9Z0W1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NgfrQ9Z0W1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NgfrQ9Z0W1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NgfrQ9Z0W1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NgfrQ9Z0W1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NgfrQ9Z0W1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NgfrQ9Z0W1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NgfrQ9Z0W1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NgfrQ9Z0W1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NgfrQ9Z0W1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NgfrQ9Z0W1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NgfrQ9Z0W1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NgfrQ9Z0W1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NgfrQ9Z0W1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NgfrQ9Z0W1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NgfrQ9Z0W1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NgfrQ9Z0W1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NgfrQ9Z0W1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NgfrQ9Z0W1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NgfrQ9Z0W1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NgfrQ9Z0W1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NgfrQ9Z0W1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NgfrQ9Z0W1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NgfrQ9Z0W1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NgfrQ9Z0W1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NgfrQ9Z0W1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NgfrQ9Z0W1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NgfrQ9Z0W1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NgfrQ9Z0W1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NgfrQ9Z0W1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NgfrQ9Z0W1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NgfrQ9Z0W1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NgfrQ9Z0W1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NgfrQ9Z0W1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NgfrQ9Z0W1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NgfrQ9Z0W1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms