Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clip2Q9Z0H8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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Clip2Q9Z0H8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
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Clip2Q9Z0H8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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Clip2Q9Z0H8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clip2Q9Z0H8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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