Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbp2Q9Z0E6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbp2Q9Z0E6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbp2Q9Z0E6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbp2Q9Z0E6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbp2Q9Z0E6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbp2Q9Z0E6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbp2Q9Z0E6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbp2Q9Z0E6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbp2Q9Z0E6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp2Q9Z0E6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp2Q9Z0E6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp2Q9Z0E6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp2Q9Z0E6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp2Q9Z0E6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp2Q9Z0E6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp2Q9Z0E6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp2Q9Z0E6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp2Q9Z0E6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp2Q9Z0E6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp2Q9Z0E6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp2Q9Z0E6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp2Q9Z0E6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp2Q9Z0E6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp2Q9Z0E6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp2Q9Z0E6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp2Q9Z0E6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp2Q9Z0E6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp2Q9Z0E6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp2Q9Z0E6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbp2Q9Z0E6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbp2Q9Z0E6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbp2Q9Z0E6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbp2Q9Z0E6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbp2Q9Z0E6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbp2Q9Z0E6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbp2Q9Z0E6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbp2Q9Z0E6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbp2Q9Z0E6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbp2Q9Z0E6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbp2Q9Z0E6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbp2Q9Z0E6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbp2Q9Z0E6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbp2Q9Z0E6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbp2Q9Z0E6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbp2Q9Z0E6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbp2Q9Z0E6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbp2Q9Z0E6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gbp2Q9Z0E6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gbp2Q9Z0E6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gbp2Q9Z0E6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gbp2Q9Z0E6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gbp2Q9Z0E6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gbp2Q9Z0E6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gbp2Q9Z0E6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gbp2Q9Z0E6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gbp2Q9Z0E6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbp2Q9Z0E6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbp2Q9Z0E6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbp2Q9Z0E6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbp2Q9Z0E6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbp2Q9Z0E6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbp2Q9Z0E6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbp2Q9Z0E6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbp2Q9Z0E6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbp2Q9Z0E6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbp2Q9Z0E6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbp2Q9Z0E6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbp2Q9Z0E6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbp2Q9Z0E6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbp2Q9Z0E6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbp2Q9Z0E6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbp2Q9Z0E6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbp2Q9Z0E6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbp2Q9Z0E6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbp2Q9Z0E6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbp2Q9Z0E6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbp2Q9Z0E6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbp2Q9Z0E6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbp2Q9Z0E6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbp2Q9Z0E6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbp2Q9Z0E6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbp2Q9Z0E6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbp2Q9Z0E6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbp2Q9Z0E6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbp2Q9Z0E6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbp2Q9Z0E6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbp2Q9Z0E6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbp2Q9Z0E6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbp2Q9Z0E6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbp2Q9Z0E6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbp2Q9Z0E6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbp2Q9Z0E6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbp2Q9Z0E6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbp2Q9Z0E6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbp2Q9Z0E6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbp2Q9Z0E6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbp2Q9Z0E6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbp2Q9Z0E6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbp2Q9Z0E6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms