Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms