Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVF7

Pole, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 2,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PoleQ9WVF7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PoleQ9WVF7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PoleQ9WVF7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PoleQ9WVF7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PoleQ9WVF7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PoleQ9WVF7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms