Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nme3Q9WV85 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nme3Q9WV85 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nme3Q9WV85 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nme3Q9WV85 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nme3Q9WV85 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nme3Q9WV85 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nme3Q9WV85 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nme3Q9WV85 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nme3Q9WV85 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nme3Q9WV85 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nme3Q9WV85 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nme3Q9WV85 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nme3Q9WV85 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nme3Q9WV85 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nme3Q9WV85 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nme3Q9WV85 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nme3Q9WV85 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nme3Q9WV85 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nme3Q9WV85 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nme3Q9WV85 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Nme3Q9WV85 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nme3Q9WV85 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nme3Q9WV85 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nme3Q9WV85 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nme3Q9WV85 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nme3Q9WV85 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nme3Q9WV85 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nme3Q9WV85 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nme3Q9WV85 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nme3Q9WV85 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nme3Q9WV85 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Nme3Q9WV85 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nme3Q9WV85 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nme3Q9WV85 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nme3Q9WV85 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nme3Q9WV85 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nme3Q9WV85 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nme3Q9WV85 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nme3Q9WV85 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nme3Q9WV85 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nme3Q9WV85 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nme3Q9WV85 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nme3Q9WV85 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nme3Q9WV85 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nme3Q9WV85 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nme3Q9WV85 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Nme3Q9WV85 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Nme3Q9WV85 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Nme3Q9WV85 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Nme3Q9WV85 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Nme3Q9WV85 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms