Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnip1Q9WUU8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnip1Q9WUU8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnip1Q9WUU8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms