Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP4

Srd5a3, Polyprenol reductase, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srd5a3Q9WUP4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srd5a3Q9WUP4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srd5a3Q9WUP4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srd5a3Q9WUP4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Srd5a3Q9WUP4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srd5a3Q9WUP4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srd5a3Q9WUP4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srd5a3Q9WUP4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srd5a3Q9WUP4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srd5a3Q9WUP4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srd5a3Q9WUP4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srd5a3Q9WUP4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srd5a3Q9WUP4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srd5a3Q9WUP4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Srd5a3Q9WUP4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srd5a3Q9WUP4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srd5a3Q9WUP4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srd5a3Q9WUP4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srd5a3Q9WUP4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srd5a3Q9WUP4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srd5a3Q9WUP4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srd5a3Q9WUP4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srd5a3Q9WUP4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srd5a3Q9WUP4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms