Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nrf1Q9WU00 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nrf1Q9WU00 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms