Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP3

Spdef, SAM pointed domain-containing Ets transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpdefQ9WTP3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SpdefQ9WTP3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SpdefQ9WTP3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SpdefQ9WTP3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SpdefQ9WTP3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SpdefQ9WTP3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SpdefQ9WTP3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SpdefQ9WTP3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SpdefQ9WTP3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SpdefQ9WTP3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SpdefQ9WTP3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SpdefQ9WTP3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SpdefQ9WTP3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SpdefQ9WTP3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SpdefQ9WTP3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SpdefQ9WTP3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SpdefQ9WTP3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SpdefQ9WTP3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SpdefQ9WTP3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SpdefQ9WTP3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SpdefQ9WTP3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SpdefQ9WTP3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SpdefQ9WTP3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SpdefQ9WTP3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SpdefQ9WTP3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SpdefQ9WTP3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SpdefQ9WTP3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SpdefQ9WTP3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SpdefQ9WTP3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SpdefQ9WTP3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SpdefQ9WTP3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SpdefQ9WTP3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SpdefQ9WTP3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SpdefQ9WTP3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SpdefQ9WTP3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SpdefQ9WTP3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SpdefQ9WTP3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SpdefQ9WTP3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SpdefQ9WTP3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SpdefQ9WTP3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SpdefQ9WTP3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SpdefQ9WTP3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SpdefQ9WTP3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SpdefQ9WTP3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SpdefQ9WTP3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SpdefQ9WTP3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SpdefQ9WTP3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SpdefQ9WTP3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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