Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms