Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Y5

Hic1, Hypermethylated in cancer 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hic1Q9R1Y5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hic1Q9R1Y5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hic1Q9R1Y5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hic1Q9R1Y5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hic1Q9R1Y5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Hic1Q9R1Y5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Hic1Q9R1Y5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hic1Q9R1Y5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hic1Q9R1Y5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hic1Q9R1Y5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hic1Q9R1Y5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hic1Q9R1Y5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hic1Q9R1Y5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hic1Q9R1Y5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hic1Q9R1Y5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hic1Q9R1Y5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hic1Q9R1Y5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hic1Q9R1Y5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms