Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1I1

Chst4, Carbohydrate sulfotransferase 4, mousemouse

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Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst4Q9R1I1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chst4Q9R1I1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Chst4Q9R1I1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Chst4Q9R1I1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Chst4Q9R1I1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chst4Q9R1I1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chst4Q9R1I1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chst4Q9R1I1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chst4Q9R1I1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chst4Q9R1I1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chst4Q9R1I1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chst4Q9R1I1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chst4Q9R1I1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chst4Q9R1I1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chst4Q9R1I1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chst4Q9R1I1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chst4Q9R1I1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chst4Q9R1I1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chst4Q9R1I1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chst4Q9R1I1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chst4Q9R1I1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chst4Q9R1I1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Chst4Q9R1I1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chst4Q9R1I1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chst4Q9R1I1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chst4Q9R1I1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chst4Q9R1I1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Chst4Q9R1I1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chst4Q9R1I1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chst4Q9R1I1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chst4Q9R1I1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chst4Q9R1I1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chst4Q9R1I1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chst4Q9R1I1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chst4Q9R1I1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chst4Q9R1I1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chst4Q9R1I1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chst4Q9R1I1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chst4Q9R1I1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chst4Q9R1I1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chst4Q9R1I1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms