Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms