Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Lamc3Q9R0B6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Lamc3Q9R0B6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Lamc3Q9R0B6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Lamc3Q9R0B6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Lamc3Q9R0B6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Lamc3Q9R0B6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Lamc3Q9R0B6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Lamc3Q9R0B6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Lamc3Q9R0B6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Lamc3Q9R0B6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Lamc3Q9R0B6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Lamc3Q9R0B6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Lamc3Q9R0B6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Lamc3Q9R0B6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Lamc3Q9R0B6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Lamc3Q9R0B6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Lamc3Q9R0B6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Lamc3Q9R0B6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Lamc3Q9R0B6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Lamc3Q9R0B6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Lamc3Q9R0B6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Lamc3Q9R0B6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Lamc3Q9R0B6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Lamc3Q9R0B6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Lamc3Q9R0B6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Lamc3Q9R0B6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Lamc3Q9R0B6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Lamc3Q9R0B6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Lamc3Q9R0B6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Lamc3Q9R0B6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Lamc3Q9R0B6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Lamc3Q9R0B6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Lamc3Q9R0B6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Lamc3Q9R0B6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Lamc3Q9R0B6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Lamc3Q9R0B6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Lamc3Q9R0B6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Lamc3Q9R0B6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Lamc3Q9R0B6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Lamc3Q9R0B6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Lamc3Q9R0B6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Lamc3Q9R0B6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Lamc3Q9R0B6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Lamc3Q9R0B6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Lamc3Q9R0B6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Lamc3Q9R0B6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Lamc3Q9R0B6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Lamc3Q9R0B6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Lamc3Q9R0B6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Lamc3Q9R0B6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Lamc3Q9R0B6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Lamc3Q9R0B6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Lamc3Q9R0B6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Lamc3Q9R0B6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Lamc3Q9R0B6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
Lamc3Q9R0B6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Lamc3Q9R0B6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Lamc3Q9R0B6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Lamc3Q9R0B6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Lamc3Q9R0B6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Lamc3Q9R0B6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Lamc3Q9R0B6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Lamc3Q9R0B6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Lamc3Q9R0B6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Lamc3Q9R0B6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Lamc3Q9R0B6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Lamc3Q9R0B6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Lamc3Q9R0B6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Lamc3Q9R0B6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Lamc3Q9R0B6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Lamc3Q9R0B6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Lamc3Q9R0B6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Lamc3Q9R0B6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Lamc3Q9R0B6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Lamc3Q9R0B6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Lamc3Q9R0B6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Lamc3Q9R0B6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Lamc3Q9R0B6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Lamc3Q9R0B6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Lamc3Q9R0B6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Lamc3Q9R0B6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Lamc3Q9R0B6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Lamc3Q9R0B6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Lamc3Q9R0B6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Lamc3Q9R0B6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Lamc3Q9R0B6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Lamc3Q9R0B6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Lamc3Q9R0B6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Lamc3Q9R0B6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Lamc3Q9R0B6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Lamc3Q9R0B6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Lamc3Q9R0B6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Lamc3Q9R0B6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Lamc3Q9R0B6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Lamc3Q9R0B6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Lamc3Q9R0B6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Lamc3Q9R0B6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Lamc3Q9R0B6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Lamc3Q9R0B6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms