Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf4Q9QZS2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms