Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ripk3Q9QZL0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ripk3Q9QZL0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ripk3Q9QZL0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ripk3Q9QZL0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ripk3Q9QZL0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ripk3Q9QZL0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ripk3Q9QZL0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ripk3Q9QZL0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ripk3Q9QZL0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ripk3Q9QZL0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ripk3Q9QZL0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ripk3Q9QZL0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ripk3Q9QZL0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ripk3Q9QZL0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ripk3Q9QZL0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ripk3Q9QZL0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ripk3Q9QZL0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ripk3Q9QZL0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ripk3Q9QZL0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ripk3Q9QZL0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ripk3Q9QZL0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ripk3Q9QZL0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ripk3Q9QZL0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ripk3Q9QZL0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ripk3Q9QZL0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ripk3Q9QZL0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ripk3Q9QZL0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ripk3Q9QZL0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ripk3Q9QZL0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ripk3Q9QZL0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ripk3Q9QZL0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ripk3Q9QZL0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ripk3Q9QZL0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ripk3Q9QZL0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ripk3Q9QZL0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ripk3Q9QZL0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ripk3Q9QZL0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ripk3Q9QZL0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ripk3Q9QZL0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ripk3Q9QZL0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ripk3Q9QZL0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ripk3Q9QZL0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ripk3Q9QZL0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ripk3Q9QZL0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ripk3Q9QZL0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ripk3Q9QZL0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ripk3Q9QZL0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ripk3Q9QZL0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ripk3Q9QZL0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ripk3Q9QZL0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ripk3Q9QZL0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ripk3Q9QZL0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ripk3Q9QZL0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ripk3Q9QZL0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ripk3Q9QZL0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ripk3Q9QZL0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ripk3Q9QZL0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ripk3Q9QZL0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ripk3Q9QZL0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ripk3Q9QZL0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ripk3Q9QZL0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ripk3Q9QZL0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ripk3Q9QZL0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ripk3Q9QZL0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ripk3Q9QZL0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ripk3Q9QZL0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ripk3Q9QZL0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ripk3Q9QZL0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ripk3Q9QZL0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ripk3Q9QZL0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ripk3Q9QZL0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ripk3Q9QZL0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ripk3Q9QZL0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ripk3Q9QZL0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ripk3Q9QZL0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ripk3Q9QZL0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ripk3Q9QZL0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ripk3Q9QZL0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ripk3Q9QZL0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ripk3Q9QZL0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ripk3Q9QZL0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ripk3Q9QZL0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ripk3Q9QZL0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ripk3Q9QZL0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ripk3Q9QZL0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ripk3Q9QZL0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ripk3Q9QZL0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ripk3Q9QZL0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ripk3Q9QZL0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ripk3Q9QZL0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ripk3Q9QZL0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ripk3Q9QZL0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ripk3Q9QZL0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ripk3Q9QZL0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ripk3Q9QZL0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ripk3Q9QZL0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ripk3Q9QZL0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ripk3Q9QZL0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ripk3Q9QZL0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms