Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ercc4Q9QZD4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ercc4Q9QZD4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ercc4Q9QZD4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ercc4Q9QZD4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ercc4Q9QZD4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ercc4Q9QZD4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ercc4Q9QZD4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ercc4Q9QZD4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ercc4Q9QZD4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ercc4Q9QZD4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ercc4Q9QZD4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ercc4Q9QZD4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ercc4Q9QZD4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ercc4Q9QZD4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ercc4Q9QZD4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ercc4Q9QZD4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ercc4Q9QZD4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ercc4Q9QZD4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ercc4Q9QZD4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ercc4Q9QZD4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ercc4Q9QZD4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ercc4Q9QZD4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms