Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms