Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Phtf1Q9QZ09 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Phtf1Q9QZ09 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Phtf1Q9QZ09 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Phtf1Q9QZ09 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Phtf1Q9QZ09 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Phtf1Q9QZ09 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Phtf1Q9QZ09 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phtf1Q9QZ09 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phtf1Q9QZ09 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phtf1Q9QZ09 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phtf1Q9QZ09 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phtf1Q9QZ09 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phtf1Q9QZ09 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phtf1Q9QZ09 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phtf1Q9QZ09 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phtf1Q9QZ09 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phtf1Q9QZ09 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Phtf1Q9QZ09 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Phtf1Q9QZ09 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Phtf1Q9QZ09 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Phtf1Q9QZ09 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Phtf1Q9QZ09 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Phtf1Q9QZ09 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Phtf1Q9QZ09 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Phtf1Q9QZ09 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Phtf1Q9QZ09 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Phtf1Q9QZ09 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phtf1Q9QZ09 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phtf1Q9QZ09 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phtf1Q9QZ09 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Phtf1Q9QZ09 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phtf1Q9QZ09 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phtf1Q9QZ09 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phtf1Q9QZ09 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phtf1Q9QZ09 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phtf1Q9QZ09 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phtf1Q9QZ09 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phtf1Q9QZ09 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phtf1Q9QZ09 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phtf1Q9QZ09 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phtf1Q9QZ09 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms