Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms