Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn4Q9QXZ9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms