Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nufip1Q9QXX8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms