Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Kcnip3Q9QXT8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnip3Q9QXT8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Kcnip3Q9QXT8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Kcnip3Q9QXT8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Kcnip3Q9QXT8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Kcnip3Q9QXT8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Kcnip3Q9QXT8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnip3Q9QXT8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnip3Q9QXT8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnip3Q9QXT8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnip3Q9QXT8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Kcnip3Q9QXT8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnip3Q9QXT8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Kcnip3Q9QXT8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Kcnip3Q9QXT8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnip3Q9QXT8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnip3Q9QXT8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnip3Q9QXT8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Kcnip3Q9QXT8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Kcnip3Q9QXT8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Kcnip3Q9QXT8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnip3Q9QXT8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Kcnip3Q9QXT8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnip3Q9QXT8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnip3Q9QXT8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnip3Q9QXT8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnip3Q9QXT8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnip3Q9QXT8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnip3Q9QXT8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnip3Q9QXT8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnip3Q9QXT8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnip3Q9QXT8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnip3Q9QXT8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnip3Q9QXT8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnip3Q9QXT8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnip3Q9QXT8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnip3Q9QXT8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnip3Q9QXT8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnip3Q9QXT8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnip3Q9QXT8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnip3Q9QXT8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnip3Q9QXT8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnip3Q9QXT8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnip3Q9QXT8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnip3Q9QXT8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms