Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trip4Q9QXN3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trip4Q9QXN3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trip4Q9QXN3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trip4Q9QXN3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trip4Q9QXN3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trip4Q9QXN3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Trip4Q9QXN3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trip4Q9QXN3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trip4Q9QXN3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Trip4Q9QXN3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trip4Q9QXN3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trip4Q9QXN3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Trip4Q9QXN3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trip4Q9QXN3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trip4Q9QXN3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trip4Q9QXN3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms