Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Copg2Q9QXK3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms