Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Limd1Q9QXD8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Limd1Q9QXD8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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