Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpc5Q9QX29 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpc5Q9QX29 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpc5Q9QX29 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpc5Q9QX29 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpc5Q9QX29 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpc5Q9QX29 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpc5Q9QX29 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpc5Q9QX29 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpc5Q9QX29 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpc5Q9QX29 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpc5Q9QX29 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpc5Q9QX29 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpc5Q9QX29 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpc5Q9QX29 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpc5Q9QX29 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpc5Q9QX29 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpc5Q9QX29 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpc5Q9QX29 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpc5Q9QX29 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpc5Q9QX29 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpc5Q9QX29 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpc5Q9QX29 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpc5Q9QX29 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpc5Q9QX29 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpc5Q9QX29 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpc5Q9QX29 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpc5Q9QX29 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpc5Q9QX29 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms