Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mid2Q9QUS6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms