Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PolkQ9QUG2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PolkQ9QUG2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PolkQ9QUG2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PolkQ9QUG2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PolkQ9QUG2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PolkQ9QUG2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PolkQ9QUG2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PolkQ9QUG2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PolkQ9QUG2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PolkQ9QUG2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PolkQ9QUG2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PolkQ9QUG2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PolkQ9QUG2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PolkQ9QUG2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PolkQ9QUG2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PolkQ9QUG2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PolkQ9QUG2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PolkQ9QUG2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PolkQ9QUG2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PolkQ9QUG2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PolkQ9QUG2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PolkQ9QUG2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PolkQ9QUG2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PolkQ9QUG2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PolkQ9QUG2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PolkQ9QUG2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms