Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdgfl3Q9JMG7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms