Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc2lQ9JME7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc2lQ9JME7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc2lQ9JME7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc2lQ9JME7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc2lQ9JME7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc2lQ9JME7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc2lQ9JME7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc2lQ9JME7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc2lQ9JME7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc2lQ9JME7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc2lQ9JME7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc2lQ9JME7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc2lQ9JME7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc2lQ9JME7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc2lQ9JME7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc2lQ9JME7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc2lQ9JME7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc2lQ9JME7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc2lQ9JME7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc2lQ9JME7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc2lQ9JME7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc2lQ9JME7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc2lQ9JME7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc2lQ9JME7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc2lQ9JME7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc2lQ9JME7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc2lQ9JME7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc2lQ9JME7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms