Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM62

Reep6, Receptor expression-enhancing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep6Q9JM62 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Reep6Q9JM62 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms