Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Higd1aQ9JLR9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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