Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cabp1Q9JLK7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cabp1Q9JLK7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cabp1Q9JLK7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cabp1Q9JLK7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cabp1Q9JLK7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cabp1Q9JLK7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cabp1Q9JLK7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cabp1Q9JLK7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cabp1Q9JLK7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cabp1Q9JLK7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Cabp1Q9JLK7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Cabp1Q9JLK7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cabp1Q9JLK7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cabp1Q9JLK7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cabp1Q9JLK7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Cabp1Q9JLK7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Cabp1Q9JLK7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cabp1Q9JLK7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Cabp1Q9JLK7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cabp1Q9JLK7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cabp1Q9JLK7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cabp1Q9JLK7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cabp1Q9JLK7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cabp1Q9JLK7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cabp1Q9JLK7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cabp1Q9JLK7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cabp1Q9JLK7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cabp1Q9JLK7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cabp1Q9JLK7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cabp1Q9JLK7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cabp1Q9JLK7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cabp1Q9JLK7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Cabp1Q9JLK7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cabp1Q9JLK7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms