Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC6

Tef, Thyrotroph embryonic factor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefQ9JLC6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TefQ9JLC6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms