Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC3

Msrb1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb1Q9JLC3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Msrb1Q9JLC3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms