Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms