Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms