Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKU8

Lmx1a, LIM homeobox transcription factor 1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1aQ9JKU8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms