Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2Q9JKK7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmod2Q9JKK7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmod2Q9JKK7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmod2Q9JKK7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmod2Q9JKK7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmod2Q9JKK7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmod2Q9JKK7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmod2Q9JKK7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmod2Q9JKK7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
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Tmod2Q9JKK7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmod2Q9JKK7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmod2Q9JKK7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmod2Q9JKK7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmod2Q9JKK7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmod2Q9JKK7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmod2Q9JKK7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmod2Q9JKK7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmod2Q9JKK7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmod2Q9JKK7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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Tmod2Q9JKK7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmod2Q9JKK7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmod2Q9JKK7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmod2Q9JKK7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmod2Q9JKK7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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Tmod2Q9JKK7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmod2Q9JKK7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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Tmod2Q9JKK7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmod2Q9JKK7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmod2Q9JKK7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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Tmod2Q9JKK7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmod2Q9JKK7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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Tmod2Q9JKK7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmod2Q9JKK7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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Tmod2Q9JKK7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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Tmod2Q9JKK7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmod2Q9JKK7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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Tmod2Q9JKK7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmod2Q9JKK7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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Tmod2Q9JKK7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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Tmod2Q9JKK7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmod2Q9JKK7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmod2Q9JKK7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmod2Q9JKK7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmod2Q9JKK7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmod2Q9JKK7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmod2Q9JKK7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmod2Q9JKK7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmod2Q9JKK7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmod2Q9JKK7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmod2Q9JKK7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tmod2Q9JKK7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmod2Q9JKK7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tmod2Q9JKK7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tmod2Q9JKK7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmod2Q9JKK7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmod2Q9JKK7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmod2Q9JKK7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmod2Q9JKK7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmod2Q9JKK7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
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