Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx20Q9JJY4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms