Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR7

Ascl3, Achaete-scute homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl3Q9JJR7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms