Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms