Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ94

Ssna1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssna1Q9JJ94 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssna1Q9JJ94 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssna1Q9JJ94 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssna1Q9JJ94 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ssna1Q9JJ94 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssna1Q9JJ94 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssna1Q9JJ94 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssna1Q9JJ94 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssna1Q9JJ94 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssna1Q9JJ94 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ssna1Q9JJ94 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssna1Q9JJ94 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssna1Q9JJ94 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssna1Q9JJ94 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssna1Q9JJ94 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssna1Q9JJ94 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssna1Q9JJ94 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ssna1Q9JJ94 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ssna1Q9JJ94 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ssna1Q9JJ94 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ssna1Q9JJ94 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ssna1Q9JJ94 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ssna1Q9JJ94 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ssna1Q9JJ94 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ssna1Q9JJ94 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ssna1Q9JJ94 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssna1Q9JJ94 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssna1Q9JJ94 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssna1Q9JJ94 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssna1Q9JJ94 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ssna1Q9JJ94 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssna1Q9JJ94 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ssna1Q9JJ94 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ssna1Q9JJ94 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ssna1Q9JJ94 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ssna1Q9JJ94 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ssna1Q9JJ94 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssna1Q9JJ94 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms