Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms