Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms