Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ccl28Q9JIL2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ccl28Q9JIL2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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