Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms