Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW4

Eefsec, Selenocysteine-specific elongation factor, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EefsecQ9JHW4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EefsecQ9JHW4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EefsecQ9JHW4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EefsecQ9JHW4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EefsecQ9JHW4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EefsecQ9JHW4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EefsecQ9JHW4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EefsecQ9JHW4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EefsecQ9JHW4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EefsecQ9JHW4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EefsecQ9JHW4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EefsecQ9JHW4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EefsecQ9JHW4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EefsecQ9JHW4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EefsecQ9JHW4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EefsecQ9JHW4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EefsecQ9JHW4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EefsecQ9JHW4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
EefsecQ9JHW4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
EefsecQ9JHW4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EefsecQ9JHW4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EefsecQ9JHW4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EefsecQ9JHW4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EefsecQ9JHW4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EefsecQ9JHW4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms